明朝灭元,定都南京,即以南京音为基础音系,南京官话为国家标准汉语语音。北方官话直到清代中叶以后逐渐取代南京官话成为中国官方的标准语。
和之前历朝一样,明朝和清朝都编有官方的韵书,如《洪武正韵》、《佩文诗韵》等。但这些韵书都承袭《平水韵》的音系,不能作为分析当时口语的依据。有些私修的描述声韵的册子,不同程度反映当时的实际语音,如明兰茂作《韵略易通》,清无名氏作《圆音正考》。
从明朝开始,陆续有西方人到中国,他们用拉丁字母标注汉字的读音,为语音的实际音值留下了宝贵的材料。如明朝有利玛窦作《西字奇迹》,金尼阁作《西儒耳目资》。除此之外,还有一些对音材料作为补充。