就保密性而言,列宁墓不亚于政府的核防设施,列宁的遗体安放在水晶棺内,棺内保持16摄氏度常温,由中央控制系统的仪器监视,各种指数都非常精确,甚至比医生要求的还要高。每天中午1时,列宁墓关闭。每逢周一和周五,列宁墓不开放。这是医护人员作例行检查的时间。
他们打开水晶棺,对遗体进行认真检查后,给死者的面部涂上特制的药液,然后再将水晶棺重新封上。此外,他们每隔18个月要对遗体进行一次专门护理。
这时,要用专车将遗体从瞻仰厅运到护理室,将其放进一个池子,用专门配制的药液浸泡一两个星期。然后,人们再重新给列宁换衣、化妆,把遗体安放好,呈“安睡”状态。一切整理就绪后,遗体又被送回瞻仰厅。 保存遗体是个巨大的科学难题。事实上,列宁逝世一个月后遗体便开始迅速腐烂,科学家们一筹莫展。而后,巴尔斯基教授用自己的防腐办法暂时遏制了遗体的腐烂。
二战期间,列宁遗体经受了最严峻的考验。1943年底,列宁的遗体开始腐烂。于是列宁遗体的一条腿和部份左肢被截去并安上人造假肢。1945年底,列宁遗体被运回莫斯科,去列宁墓参观的人都发现,列宁显得年轻了。 1961年,当斯大林的遗体被从列宁墓搬出后,列宁的遗体又开始腐烂。此时,巴尔斯基教授已去世,他的接班人在遗体紧急防腐处理方面经验不足,于是赫鲁晓夫同医务人员商定,将暂时尚未腐烂的头部同躯干分开。同时决定制作人体模型代替原来的身体。手术进行得相当成功,列宁的躯干被火化,头部被安装到一个人造躯体上。一切都做得天衣无缝,参观者丝毫没察觉。