佩恩的本体就是漩涡长门,漩涡一族的后裔,晓组织的首领,雨之国雨忍村的首领。拥有宇智波斑所给予的轮回眼,是佩恩六道的操控者。原为第二次忍界大战雨忍村的战争孤儿,在识别了小南和弥彦后跟随自来也学习忍术。一生经历了父母双亡及弥彦之死两大痛楚,决定在痛苦的轮回中孕育和平。后被漩涡鸣人感化,重拾少年时期的梦想,用轮回天生之术复活了佩恩袭击木叶一战中死去的人,将自己的意志托付给鸣人后力竭而亡。在第四次忍界大战中被药师兜复活当做工具,被宇智波鼬,漩涡鸣人和奇拉比联手封印。
长大后的三人以弥彦为首创立了晓组织。立志不靠极端武力来创造世界和平,之后有许多人加入了这个组织,组织逐渐壮大并声名鹊起。远在木叶的自来也还偶尔听到他们在几次战斗的事迹。
当时的雨忍村的首领山椒鱼半藏受到志村团藏的蛊惑,害怕他们势力的扩大会威胁到自己的统治地位,所以半藏欺骗他们说,想借用他们的力量,向火、风、土三大国提出和平的交涉提案(因为雨忍村处在三大国的交接处,战略地位非常重要,而且当时第三次忍界大战愈演愈烈),弥彦答应了他的请求。但是他们到了会谈的地点,才发现这是个圈套,半藏勾结团藏,在会谈地点埋伏,参与抹杀他们三个的还有木叶的暗部。半藏以事先擒获的小南的性命作要挟让长门杀了弥彦,弥彦为了救小南让长门杀了自己。在不知如何抉择之时,弥彦撞到了长门的苦无上,倒在了长门身旁。就当半藏要将他们全部歼灭的时候,长门挡住了半藏的手下的所有攻击,然后救下小南,双腿中了半藏的火遁。眼见遭受欺骗,挚友又死于眼前,在极度愤怒之下使用轮回眼召唤出外道魔像,震惊了全场所有人。之后木叶的暗部和半藏的手下都被外道魔像抽取灵魂,半藏、团藏落荒而逃。
弥彦死后,长门成为了晓的首领,并使用轮回眼制出了尸体傀儡佩恩六道,弥彦的遗体被长门制作成为佩恩六道之中的天道佩因,用来统率晓组织。
佩恩:〖Pain〗即取自英文:痛苦、惩罚之意,作者岸本齐史早以在此处埋下伏笔。漫画中的佩恩为长门自己所起,呼应痛苦、惩罚之意。