Simone
中国女性一直被视为弱者身分，依附在传统价值观及制度下生存。然而，面对国势动荡，时局混乱，传统价值亦受到冲击；逆境求生，女性如何自处？杜佳期(钟嘉欣饰)身陷这个大时代的变迁中，一方面要面对医药家业的没落，肩负起自身家族的命运；同时还要打破迂腐的传统制度，克服困难。
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一个民初女性绝处求生，但求靠著中医知识，在乱世之中找到一片天！
百年老店
大药堂「杜氏尚春堂」在佛山声名显赫，历代掌舵人皆是医术高超的名医。到了民国初年，尚春堂由杜蔘(杜燕歌饰)经营，期间一场翻天覆地的巨变，却把百年辉煌的尚春堂拉进了绝路！
杜家女儿杜佳期与佛山市长长子庄继祖(黄浩然饰)结婚在即，杜家上下为迎接这场大婚礼，把药仓的老鼠赶得乱走一通，一群无知的外省贫民却视这些「过街老鼠」为灵丹妙药，伺机抢鼠，「以鼠入药」！佳期得悉後，不顾婚前禁忌，要求未婚夫继祖一同赶往金玉里阻止贫民！期间，佳期在机缘巧合下，认识了外表市侩的倒卖商人丁一元(陈展鹏饰)。
继祖回家後，隔天便感不适，被送到尚春堂诊治。其後发现继祖与大批佛山市民染上春瘟，并将矛头直指外省贫民。继祖为免群情恶化，安排外省贫民留在市政厅接受看管，杜蔘为配
TVB剧新剧大药坊剧照
合女婿，亦承诺以三日为限，开机制药，广派佛山。然而，杜蔘这个承诺，却令杜家走上一条不归路！
声誉尽毁
杜蔘为了加快药效，用上极险的「十八反」药方，制成「九九正气丸」，并向市民免费派发。佳期发现有病妇向一元卖药换钱，一元不但不收取药丸，还向对方反赠金钱，佳期对一元心生敬意。
「九九正气丸」总算将病情镇住，佛山全市回复歌舞升平，这时候却来了一个比市长更有权势、为人专横跋扈的许崇明师长(岳华饰)。许师长得知尚春堂赠医施药的佳话，召见杜蔘欲测试他的本领，杜蔘却指他酒色过度，令许师长尴尬不已，二人暗里结下梁子。
一波未平，一波又起，原来当日所开的「十八反」受了污染，令药材变了毒材。继袓高烧不退，亦有市民服後呕吐不止。杜蔘忙向继袓施针急救，继袓却突然大吐鲜血。另一边厢，居於金玉里的外省小孩亦告病发，幸得当地一位隐世大夫常锡庚(蔡国庆饰)及时相救，成功以豆浆解毒。一元得悉後，带同大量豆浆赶到尚春堂救人，继祖却因杜蔘的诊断出错而未能对症下药，失救至死。继祖父母悲恸不已，并认为继祖的死乃杜家一手造成，与此同时，许师长下令把尚春堂查封，杜蔘亦遭收监。
杜家由天堂骤然跌进地狱！庄家本来对杜家赶尽杀绝，幸而此时，一直在东洋留学的庄继宗(黄浩然分饰)归国，阻止继续逼害杜家！
佳期落难
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一夜之间，尚春堂变成过街老鼠，人人避之则吉。佳期这个未亡人欲参与继祖丧礼，却被无情地拒诸门外，後在一元的帮助下，才得以送继祖最後一程，至此佳期与一元结成好友。一元透过魏俊(沈震轩)接收了从尚春堂充公所得的财物，佳期以为一元医治绝症作条件，希望一元为她保留尚春堂的物品。在金玉里，佳期还认识了清末御医常锡庚。锡庚手执宫廷珍贵医书，惜思想偏执古怪，以致门堪罗雀，唯佳期胜在灵活变通，反而为锡庚找来不少生意。自此，佳期成为锡庚的助手，一边学习其绝世医学，一边学以致用，医治金玉里的贫苦大众，踏上日後成为第一女医师的第一步。
也许最后丁一元当了杜家的上门女婿了。
