Simone
两者没有区别，一般in pairs较常用，意思是成对地、成双地、两个、两个地。pair作名词时，意思是一对、一双、分两个相连接部分的物体、两个共事（或有特殊关系）的人；作动词时意思是配对、使成对、交配。
例句：1、They marched out singly or in pairs
他们一个一个地或成双成对地走出来。
2、The students walked to the school gate in pairs.
学生们成对儿地向校门口走去。
3、The children came in pairs.
孩子们两个两个地进来。
4、Now work in pairs and say what you can see.
现在结对练习，说出你所看见的动物。
5、Since there's an even number of us we can work in pairs.
我们人数为偶数，所以可以配成对干活。
